第一步概要申报：(1)登录国际贸易“单一窗口”；(2)进入“两步申报”模块；(3)选择“是否涉证”、“是否涉税”、“是否涉检”；(4)按照系统界面要求录入相关信息。

    第二步完整申报：(1)登录“单一窗口”；(2)进入“两步申报”模块；(3)查找已完成概要申报并可以进行完整申报的报关单，按照系统界面要求录入相关信息。

    加工贸易及海关特殊监管区域内企业以及保税监管场所的货物申报在使用金关二期系统开展“两步申报”时，第一步概要申报环节不使用保税核注清单，第二步完整申报环节报关单按原有模式，由保税核注清单生成。

    概要申报与完整申报均需要在自行运输工具申报进境之日起14日内完成。概要申报可以实施提前申报。自运输工具申报进境之日起14天后申报的不适用“两步申报”，可采用“一次申报、分步处置”模式进行申报。

    一是确认自身信用等级是否为一般信用及以上；二是进口货物涉税的需确认是否已经办理税收担保备案；三是进口货物涉证的，确认监管证件类型已经实现联网核查（42种监管证件类型以内的）。

    在概要申报阶段，企业必须按照货物实际情况，如实选择是否需要检验或检疫，是否涉及监管证件，是否需要缴纳税款，并且承诺在规定时限内进行完整申报。对于一线进境特殊监管区域货物或者加工贸易进口货物，在完整申报时需采用区港联动核注清单，企业从金关二期加贸系统录入或导入核注清单，在核注清单表头填写已放行的报关单号，核注清单预审核通过后，自动生成报关单草单数据，在国际贸易“单一窗口”中查询核注清单生成的完整申报的报关单草稿进行补充修改，提交完整申报。

    涉税货物需提供税款担保。

    对涉税货物，企业需提前向注册地直属海关关税职能部门提交税收担保备案申请，税收担保应依法以海关认可的形式，受益人应包括企业注册地直属海关以及其他进出口地直属海关，企业担保额度以企业上一年度的月均纳税额或上一年度的单月最大纳税额作为参考标准，由属地海关关税职能部门审定。新注册企业的额度由属地海关关税职能部门根据企业申报的年度进口计划审定。担保额度可根据企业税款缴纳情况循环使用。

    注意，已办理汇总征税担保备案的可用于“两步申报”，无需重新办理。

    进境货物属于禁限管制，且相关证件已实现联网核查的，概要申报时需勾选“涉证”。

    进口货物列入《出入境检验检疫机构实施检验检疫的进出境商品目录》（简称《法检目录》），以及虽未列入《法检目录》但根据法律法规需实施检验或检疫的为涉检报关单。

    不属于禁限管制且不属于依法需检验检疫的：申报9个项目并确认涉及物流的2个项目，应税的须选择符合要求的担保备案编号。9个项目为境内收发货人、运输方式/运输工具名称及航次号、提运单号、监管方式、商编（6位）、商品名称、数量及单价、总价、原产国（地区）。确认涉及物流的2个项目为毛重、集装箱号。

    属于禁限管制的需增加申报2个项目：许可证号/随附证件代码及随附证件编号、集装箱商品项号关系。

    依法需检验检疫的需增加申报5个项目：产品资质（产品许可/审批/备案）、商编（10位）+检验检疫名称、货物属性、用途、集装箱商品项号关系。

    第二步完整申报，申报界面与原整合申报一致，企业完成105项全项申报。完整申报允许补齐概要申报时仅申报6位商品编码至10位（原6位HS编码不能变，只能增加后4位），允许企业按实际成交总价修改总价，其余概要申报字段不允许修改。

(1)概要申报报关单。当系统回执为“概要申报退单”时，允许对概要申报字段进行修改。当系统回执为“概要申报入库”“概要申报审结”“查验通知”时，仅允许查看不允许修改。如果确定“概要申报”申报错误，企业应按报关单撤销有关规定撤销概要申报报关单后再重新申报。

(2)在进行完整申报的报关单。除“总价”可按照实际成交总价进行修改以及6位商编补充至10位以外，其余数据项不能修改。（商编前6位也不允许修改）

(3)完整申报审结后的报关单。参照现有模式进行报关单修改撤销。

若概要申报报关单撤销后重新申报超过申报时限的，应按“一次申报、分步处置”模式进行申报，产生的滞报金按相关规定执行。